Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms