Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms