Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms