Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms