Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms