Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms