Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms