Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HHIPL1Q96JK4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms