Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms