Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms