Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms