Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJA3Q96EY1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms