Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms