Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms