Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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