Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms