Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC4Q8TBB5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms