Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF248Q8NDW4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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