Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms