Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms