Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD12Q8N8I0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms