Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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