Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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RAB11FIP4Q86YS3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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RAB11FIP4Q86YS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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RAB11FIP4Q86YS3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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