Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms