Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms