Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms