Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL4Q6XD76 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms