Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A10Q6U841 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms