Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms