Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms