Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms