Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFCAB12Q6NXP0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms