Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRT80Q6KB66 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms