Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms