Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSBN1Q5VWQ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms