Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms