Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms