Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms