Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXN3Q5MJ09 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms