Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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