Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms