Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms