Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms