Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms