Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms