Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q499Y3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q499Y3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q499Y3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q499Y3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms