Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms