Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MICAQ29983 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MICAQ29983 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MICAQ29983 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms