Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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