Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CCDC142Q17RM4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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CCDC142Q17RM4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CCDC142Q17RM4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CCDC142Q17RM4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CCDC142Q17RM4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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